Uygulamalı Matematik Tezli Yüksek Lisans programına kabul edilen öğrenciler araştırma yapmaya, tez ve makale yazmaya yardımcı olacak zorunlu “Bilimsel Araştırma Teknikleri” dersini(6 AKTS), benzer şekilde araştırma yapma, sunum hazırlama ve ders anlatma becerilerini geliştirecek zorunlu “Seminer” dersini(12 AKTS) ve bunlara ek olarak alanlarında yetkinlik kazanıp uzmanlaşmaları için seçecekleri 7 adet seçmeli ders(42 AKTS) alarak tez(60 AKTS) yazmaya hak kazanırlar.