Moleküler Biyoloji ve Genetik
Moleküler Biyoloji ve Genetik
Doç.Dr. M.BURCU IRMAK YAZICIOĞLU
Bölüm Başkanı / Fen Edebiyat Fakültesi / Moleküler Biyoloji ve Genetik


Kişisel Bilgiler
DOĞUM YERİ / TARİHİ
:
İstanbul / 14.09.1973
MEDENİ DURUMU
:
Evli , 2 çocuklu
İŞ ADRESİ
:
Sütlüce Mah. İmrahor Cad. No: 82 34445 Beyoğlu/İstanbul
TEL
:
2129242444 Dahili: 1118
FAKS
:
E-POSTA
:
Eğitim Bilgileri
LİSANS
:
Boğaziçi Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik, 06-1996
YÜKSEK LİSANS
:
Bilkent Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik, 07-1998
DOKTORA
:
Bilkent Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik
DOÇENTLİK
:
Haliç Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik, 02- 2013
PROFESÖRLÜK
:
ÜYELİKLER
Moleküler Kanser Araştırma Derneği (MOKAD)
İŞ TECRÜBELERİ
YarızamanlıÖğretimGörevlisi Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, SabancıÜniversitesi 2004 Şubat-2004 Haziran
YarızamanlıÖğretimGörevlisi Fen ve Edebiyat Fakültesi, Fatih Üniversitesi 2004 Eylül-2005 Ocak
Yar. Doç. Fen ve Edebiyat Fakültesi, Fatih Üniversitesi 2005 Şubat-2009 Ağustos
YarızamanlıÖğretimGörevlisi Fen ve Edebiyat Fakültesi, Haliç Üniversitesi 2009 Eylül-2010 Şubat
Yar. Doç. Fen ve Edebiyat Fakültesi, Haliç Üniversitesi 2010 Mart-2013 Ekim
Doç. Dr. Fen ve Edebiyat Fakültesi, Haliç Üniversitesi 2013 Kasım

RNA Dünyası-Lisans
Moleküler Genetik I-Lisans
Genetik Mühendisliği-Lisans
Kanser Biyolojisi ve Genetiği-Lisans
Moleküler Biyoloji ve Genetikte Araştırma Teknikleri I
İleri Kanser Biyolojisi I- Lisansüstü
Seminer-Lisansüstü
Moleküler Genetik II-Lisans
Genetik Mühendisliği-Lisans
Moleküler Biyoloji ve Genetikte Araştırma Teknikleri II
İleri Kanser Biyolojisi II- Lisansüstü
Seminer-Lisansüstü
Kanser Biyolojisi ve Genetiği
Moleküler Biyoloji Uygulamaları Laboratuvarı IA
Moleküler Biyoloji Uygulamaları Laboratuvarı IB
Moleküler Biyoloji Uygulamaları I
İleri Moleküler Biyoloji Teknikleri I
Gen Terapisi
Moleküler Biyoloji Uygulamaları Laboratuvarı IA
Moleküler Biyoloji Uygulamaları Laboratuvarı IB
Moleküler Biyoloji Uygulamaları
İleri Kanser Biyolojisi II
Rekombinant DNA Teknolojisi





Kazanılan Burs ve Ödüller
Bilkent Üniversitesi, Fen-Mühendislik Bilimleri Enstitüsü Yüksek Lisans Bursu, 1996-1998.
Bilkent Üniversitesi, Fen-Mühendislik Bilimleri Enstitüsü Doktora Bursu, 1998-2003.
TÜBİTAK Bilimsel Teşvik, 2006-2009.
Yönettiği / Görev Yaptığı Projeler

Gastrik karsinomalarda moleküler yolakların analizi (Analysis of molecular pathways in gastric carcinoma), Fatih ÜniversitesiAraştırmaProjeFonu, Yürütücü,2005- 2006.
RNaseP’nin Helikobakter patojenitesinde olası rolü (Possible Role of RNase P in Pathogenecity of Helicobacter Pylori), Fatih Üniversitesi Araştırma ProjeFonu,Yürütücü, 2005-2006.
Kolisistitis ve kolilitiasisi olan hastaların safra kesesi dokularında H. Pilori genomu varlığının analizi (Analysis of presence of H. pylori genomes in gall bladder tissues of patients with cholecystitis and cholelithiasis), Fatih Üniversitesi Araştırma Proje Fonu,Araştırmacı, 2005-2006.
Oksidatif Stresin Mide Kanserindeki Rolü, TÜBİTAK, 105S352, Yürütücü, 2006- 2009.
Mide kanseri, peptik ülser ve gastritli Türk hastalardan elde edilen Helicobacter Pylori izolatları cagA genlerininmoleküler tiplendirilmesi, DPT, Araştırmacı, 2007-2009.
Bir mikrobiyel yakıt hücresinde hidrojen bakterileri Shewanella putrefaciens tarafından organik atıklardan elektrik üretimi, DPT, EşYürütücü,2007-2010.
Gastrik Kanserlerde Matris Metalloproteinaz-3 Geninin Promotör Bölgesi 5A/6A Poimorfizm Analizi, HaliçÜniversitesi, Yürütücü, 2009-2012.
Mide Kanserlerinde Matris Metalloproteinaz-7 Geninin Promotör Bölgesindeki (-181A/G) Polimorfizminin İncelenmesi, Haliç Üniversitesi, Yürütücü, 2011-2013, 2500 TL
Mide Kanserlerinde Matris Metalloproteinaz-8 Geninde C-799T Polimorfizminin Analizi, HaliçÜniversitesi, Yürütücü, 2011-2013, 2500 TL
Mide kanserinde MMP-9 Promotör Polimorfizminin (-1562C/T) İncelenmesi, HaliçÜniversitesi, Yürütücü,2014-2015, 2500 TL
Şermin DURAK, (2014- ) ALK, ROS1 ve EGFR Negatif Küçük Hücreli Dışı Akciğer Karsinomlu hastalarda BRAF Mutasyonu Analizi, HaliçÜniversitesi, Yürütücü,(2015-
Melike ÖMERUSTAOĞLU, (2014- 2016) Mide kanserinde MMP-21 geni C572T (rs10901425) polimorfizminin incelenmesi, HaliçÜniversitesi, Yürütücü,(2015-2016)
Burcu KARA, (2014- ) Mide kanserinde p53 geninde Kodon 72 Arginin (CGC) ve Prolin (CCC) Polimorfizminin incelenmesi, Haliç Üniversitesi, Yürütücü,(2015-
Mide Kanseri Hücre Hatlarında Polimorfik H. Pylori Virülans Faktörleri ile Ilişkili MiRNA Profilinin Belirlenmesi ve MiRNA Hedef Genlerinin
Tespiti, TÜBİTAK, 115S258, Yürütücü,
19.11.2013- Haliç Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fakülte Yönetim Kurulu Üyesi
05.12.2013- Haliç Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fakülte Kurulu Üyesi
23.11.2015- Haliç Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Fakülte Yönetim Kurulu Üyesi
23.11.2015- Haliç Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Fakülte Kurulu Üyesi
11 Nisan 2016- Haliç Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölüm Başkanı
22.06.2016- Haliç Üniversitesi Fen bilimleri Enstitüsü Yönetim Kurulu Üyesi
22.06.2016- Haliç Üniversitesi Fen bilimleri Enstitü Kurulu Üyesi
12.07 2016- Haliç Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Dekan Yardımcısı
15.07.2016 – Haliç Üniversitesi Psikoloji Bölüm Başkan Vekili
24.08.2016- Haliç Üniversitesi Etik Kurul Üyesi
2016 Ekim- Haliç Üniversitesi BİLTEK Müdür Yardımcısı
Yönetilen Tezler
6.1. Yüksek Lisans Tezleri
Şen Gürkan, (2007-2009). The Analysis of Wnt Pathway In Gastric Cancer (Mide Kanserinde Wnt Sinyal Yolunun Analizi), Fatih Üniversitesi
Demir Serkan, (2009-2012). Gastrik Kanserlerde Matris Metalloproteinaz-3 Geninin Promotör Bölgesi 5A/6A Polimorfizm Analizi, Haliç Üniversitesi
Gündoğdu Kaan, (2011-2013). Kronik böbrek yetersizliği hastalarında idrar bulundurmayan mesane dokusunda IL-8, CXCR1 ve CXCR2’nin gen ifadelerinin araştırılması, Haliç Üniversitesi
Ketenci Ayşe Deha, (2011-2013). Mide Kanserlerinde Matris Metalloproteinaz-7 Geninin Promotör Bölgesindeki (-181A/G) Polimorfizminin İncelenmesi, Haliç Üniversitesi
Kıyan Hilal, (2011-2013). Kronik böbrek yetersizliği hastalarinda idrar bulundurmayan mesane dokusunda apoptotik bulgularının incelenmesi, Haliç Üniversitesi
Gürbüz Burcu, (2011-2013). Mide Kanserlerinde Matris Metalloproteinaz-8 Geninde C-799T Polimorfizminin Analizi, Haliç Üniversitesi
Doğru Zeynep, (2013-2015). Mide kanserinde MMP-9 Promotör Polimorfizminin (-1562C/T) İncelenmesi, Haliç Üniversitesi
Ömerustaoğlu Melike, (2014- 2016). Mide kanserinde MMP-21 geni C572T (rs10901425) polimorfizminin incelenmesi, Haliç Üniversitesi.
Durak Şermin, (2014- ). ALK, ROS1 ve EGFR Negatif Küçük Hücreli Dışı Akciğer Karsinomlu hastalarda BRAF Mutasyonu Analizi, Haliç Üniversitesi.
Kara Burcu, (2014- ). Mide kanserinde p53 genindeKodon 72 Arginin (CGC) ve Prolin (CCC) Polimorfizminin incelenmesi, Haliç Üniversitesi
Aydındağ Pınar, (2016- ). Mide Kanseri Hücre Hatlarında Vincristine İle İndüklenmiş Kanser Kök Hücrelerinin Tayini Ve İlaç Hassasiyetinin Belirlenmesi, Haliç Üniversitesi.

Erdoğan Ferhat, (2016- ). Mide kanserinde H.pylori VacA varyasyonları ile ilişki miRNA hedef genlerinin tespit edilmesidir.Haliç Üniversitesi.

Osum Meryem, (2016- ). Mide kanserinde H. Pylori CagA varyasyonlarıyla ilişkili miRNA hedef genlerinin tespit edilmesidir. Haliç Üniversitesi.

Şener Şafak, (2016- ). Mide kanserinde Polimorfik H. pylori virulans faktörleri ile ilişkili miRNA profilinin belirlenmesi..Haliç Üniversitesi.

6.2. Doktora Tezleri
Gencer Salih, (2004-2009). Mide Kanserlerinde Matriks Metalloproteinaz (MMP) Genlerinin İfadesi Üzerine Oksidatif Stres ve RNA Müdahalesinin Etkisi, Diğer Danışman: Prof. Dr. Hikmet Geçkil, İnönü Üniversitesi.
Yayın Listesi
7.1. Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI & SSCI &ArtsandHumanities)
M.C. Yakicier, M.B. Irmak, A. Roman, M. Kew, and M. Ozturk, "Smad2 and Smad4 gene mutations in hepatocellular carcinoma", Oncogene (ISI), 18, 4879-4883, 1999.
M.B. Irmak, G. Ince, M. Ozturk, and R. Cetin-Atalay, "Acquired Tolerance of Hepatocellular Carcinoma Cells to Selenium Deficiency: A Selective Survival Mechanism?", Cancer Research (ISI), 63, 6707-6715, 2003.
B. Sayan, N.C.T. Emre, M.B. Irmak, M. Ozturk, and R.Cetin-Atalay, "Nuclear exclusion of p33ING1b tumor suppressor protein: explored in HCC cells using a new highly specific antibody", Hybridoma (ISI), 28, 1-6, 2009, DOI: 10.1089/hyb.2008.0058.
N.M. Aghatabay, A. Baş, A. Kircali, G. Sen, M.B. Yazicioğlu, F. Gücin, B. Dülger, "Synthesis, Raman, FT-IR, NMR spectroscopic characterization, antimicrobial activity, cytotoxicity and DNA binding of new mixed aza-oxo-thia macrocyclic compounds", European Journal of Medicinal Chemistry (ISI), 44(11), 4681-4689, 2009, DOI: 10.1016/j.ejmech.2009.07.003.
S. Gencer, G. Sen, G. Dogusoy, A.K. Belli, M. Paksoy, M.B. Irmak-Yazicioglu, "ß-catenin Independent NoncanonicalWnt Pathway Might Be Induced In Gastric Cancers", The Turkish Journal of Gastroenterology (ISI) , 21(3), 224-230, 2010, DOI: 10.4318/tjg.2010.0092.
S.Gencer, and M.B. Irmak-Yazicioglu, "Differential Response of Gastric Carcinoma MKN-45 and 23132/87 Cells to H2O2 Exposure", The Turkish Journal of Gastroenterology (ISI), 22(2), 145-151, 2011, DOI: 10.4318/ tjg.2011.0183.
S. Gencer, A. Cebeci, M.B. Irmak-Yazicioglu, "Silencing of the MMP-3 gene by siRNA transfection in gastric cancer AGS cells", Journal of Gatsrointestinal and Liver Diseases (ISI), 20(1), 19-26, 2011.
S. Gencer, A. Cebeci, M.B. Irmak-Yazicioglu, "Matrix metalloproteinase gene expressions might be oxidative stress targets in gastric cancer cell lines", Chinese Journal of Cancer Research (ISI), 25(3), 322-333, 2013.
A.M. Gökçe, H. Fındık, P. Ata, G. Gümrükçü, L. Özel, K. Gündoğdu, B. Yazıcıoğlu, M.İ. Titiz,“Relationship of Urothelial Gene Expressions in Urine-Deprived Bladders of Renal Recipients With Posttransplant Urinary Infections”,Transplantation Proceedings (ISI), 47(5):1331-1335, DOI: 101016/j.transproceed.2015.04.080, 2015.
Irmak-Yazicioglu M.B., “Mechanisms of MicroRNA Deregulation and MicroRNA Targets in Gastric Cancer”, Oncology Research and Treatment (ISI), DOI: 10.1159/000443224, 2016.
7.2. Uluslararası diğer hakemli dergilerde yayınlanan makaleler
G. Sen, and M.B. Irmak-Yazicioglu, "Secondary Structural Changes of RnpB might affect the Pathogenicity of Helicobacter Pylori", Journal of Cell and Molecular Biology, 8(2), 113-123, 2010.

7.3. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler
T. Karabiyik, G.B. Dogusoy, M. Paksoy, A.K. Belli, F. Aydogan, M.B. Irmak-Yazicioglu, 31st FEBS Congress konferansı dahilinde "FEBS Journal (ISI)" bildiri kitapçığındaki "The effect of MMP26 gene expression in tumorigenesis and invasiveness of gastric carcinoma", 348, İstanbul, Türkiye, Haziran 2006.
T. Karabiyik, G.B. Dogusoy, M. Paksoy, A.K. Belli, F. Aydogan, Cetin, S.E., Goksel, S., Kepil, N., M.B. Irmak-Yazicioglu, 21st European Congress of Pathology konferansıdahilinde "VIRCHOWS ARCHIV (ISI)" bildirikitapçığındaki "The effect of MMP-26 gene expression in tumorigenesis and invasiveness of gastric carcinoma.", 228, İstanbul, Türkiye, Eylül 2007.
S. Gencer, G. Dogusoy, A.K. Belli,M.B. Irmak-Yazicioglu, 33rd FEBS Congress and 11th IUBMB Conference konferansı dahilinde "FEBS Journal (ISI)" bildiri kitapçığındaki "Expression of MMP-2 and MMP-9 in gastric cancer", 263, Atina, Yunanistan, Haziran-Temmuz 2008.
G. Sen, S. Gencer, G. Dogusoy, A.K. Belli, M. Paksoy, M.B. Irmak-Yazicioglu, 33rd FEBS Congress and 11th IUBMB Conference konferansı dahilinde " FEBS Journal (ISI)" bildiri kitapçığındaki "Analysis of wnt ligands and β-catenin in gastric tumors", 309, Atina, Yunanistan, Haziran-Temmuz 2008.
S. Gencer, G. Sen, M.B. Irmak-Yazicioglu, G. Dogusoy, A.K. Belli, 33rd FEBS Congress and 11th IUBMB Conference konferansıdahilinde "FEBS Journal (ISI)" bildirikitapçığındaki "Noncanonical pathway stimulator Wnt5a is upregulated in gastric carcinoma", 348, Atina, Yunanistan, Haziran-Temmuz 2008.
G. Sen, M.B. Irmak-Yazicioglu, 33rd FEBS Congress and 11th IUBMB Conference konferansıdahilinde "FEBS Journal (ISI)" bildirikitapçığındaki "Helicobacter pylori infection down regulate frizzled genes expressions in gastric cancer cell lines", 357, Atina, Yunanistan, Haziran-Temmuz 2008.
M.B. Irmak-Yazicioglu, Anıl Cebeci, SalihGencer, 4th International Congress of MolecularMedicine konferansı dahilinde “IN VIVO” Bildiri kitabındaki “Targeting MMP-3gene bysiRNAtransefction in gastriccancer AGS cells”, İstanbul, Türkiye, Haziran 2011.
M.B. Irmak-Yazicioglu, S. Gencer, European Biotechnology Congress konferansı dahilinde “CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY (ISI)” bildirikitapçığındaki “Differential apoptotic, oxidative stress, and MMP-7 expression response of MKN-45 and 23132/87 gastric carcinoma cell lines to H2O2 exposure”, 102,İstanbul, Türkiye, Eylül-Ekim 2011, DOI: 10.1016/j.copbio.2011.05.321.
H. Findik, K. Gundogdu, A.M. Gokce, B. Irmak-Yazicioglu, P. Ata, M.I.Titiz, 23rd ESOT Basic Science Meeting and13th TTS Basic ScienceSymposium dahilinde, bildiri kitapçığında “Urothelial gene expressions in urinedeprivedbladder of renaltransplantrecipients”, 150, Paris, Fransa, Kasım 2013.
Z. Doğru , A.K. Belli, G.B Doğusoy, M. Paksoy, M. B Irmak-Yazıcıoğlu, IV. International Congress of the Molecular Biology Association of Turkeykonferansı dahilinde, Özet Kitabındaki, “Relationship Between MMP-9 (-1562 C/T) Promoter Polymorphism And Gastric Cancer”, 81, Ankara, Türkiye, Kasım 2015.

7.4. Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler
M. Ozturk, E. Erdal, N. Ozturk, R. Cetin-Atalay, and B. Irmak, H.E. Blum, M.P. Manns, State of the Art of Hepatology: Molecular and Cell Biology (Liver cell biology: differentiation and malignant transformation), 64-73 pp., Dordrecht Hollanda, Kluwer Academic Publishers, 2004

7.5. Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler
7.6. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler
T. Öğretmen, G. Şen, M.B. Irmak-Yazıcıoğlu, 15. Ulusal Biyoloji Öğrenci Kongresi konferansı dahilinde "15. Ulusal Biyoloji Kongresi Özet Kitabı" bildiri kitapçığındaki "Mide kanseri hücrelerinde LiCl muamelesinin Wnt sinyal yolu üzerine olan etkisi", 59, Gaziantep, Türkiye, Ağustos 2008.
S. Gencer, G. Doğusoy, M. Paksoy, A.K. Belli,, F. Aydoğan, M.B. Irmak-Yazıcıoğlu, 19. Ulusal Biyoloji Kongresi konferansı dahilinde "19. Ulusal Biyoloji Kongresi Özetler" bildiri kitapçığındaki "Gastrik kanserde MMP-7, MMP-26 ve β-katenin genlerinin ekspresyon analizi", 553, Trabzon, Türkiye, Haziran 2008.
G. Şen, S. Gencer, G. Doğusoy, M.B. Irmak Yazıcıoğlu, VIII. Ulusal Tıbbi Genetik Kongresi konferansı dahilinde "Program ve Bildiri Özet Kitabı" bildiri kitapçığındaki "Frizzeled genlerinin mide kanserindeki ekspresyon analizi.", 246, Çanakkale, Türkiye, Mayıs 2008.
G. Şen, S. Gencer, G. Doğusoy, A.K. Belli, M. Paksoy, M.B. Irmak Yazıcıoğlu, VIII. Ulusal Tıbbi Genetik Kongresi konferansı dahilinde "Program ve Bildiri Özet Kitabı" bildiri kitapçığındaki "Gastrik kanserlerde β-katenin ve Wnt ligantlarının analizi", 247, Çanakkale, Türkiye, Mayıs 2008.
Z. Doğru, A. K. Belli, G. B. Doğusoy, M.Paksoy, M. B. Irmak-Yazıcıoğlu, 21. Ulusal Kanser Kongresi, dahilinde, "Kongre Bildiri Kitapçığındaki”, “Mide Kanserinde MMP-9 Promotör Polimorfizminin (-1562 C/T) İncelenmesi”, pp 654, Antalya, Türkiye, Nisan 2015.

7.7. Diğer yayınlar
G. Şen, S. Gencer, M.A. Abasıyanık, M.B. Irmak-Yazıcıoğlu, II. Multidisipliner Kanser Araştırma Sempozyumu dahilinde Kongre cd'sindeki "Frizzled 1, Frizzled 3 ve Frizzled 4 genlerinin mide kanserindeki ekspresyon analizi", poster bildiri, 51, Bursa, Türkiye, Şubat 2008.
G. Şen, S. Gencer, M.A. Abasıyanık, M.B. Irmak-Yazıcıoğlu, II. Multidisipliner Kanser Araştırma Sempozyumu dahilinde Kongre cd'sindeki "Helikobakterpilori ile enfekte olmuş Mkn-45 Ve 23132/87 hücre soylarında β–catenin, Mmp-7 ve Mmp-26 genlerinin ekspresyon analizi", poster bildiri, 53, Bursa, Türkiye, Şubat 2008.
G. Dogusoy, N. Kepil, A.S. Demiröz, S. Gencer, M. Paksoy, A.K. Belli, M.B. Irmak-Yazicioglu, II. Multidisipliner Kanser Araştırma Sempozyumu dahilinde Kongre cd'sindeki "Gastrik karsinomlarda Mmp-26, Mmp-7 ve β–catenin ekspresyonlarının araştırılması", poster bildiri, 39,Bursa, Türkiye, Şubat 2008.
U. Djakbarova, E. Coşkun, Ü. Güven, Ş. Karaman, M.B. Irmak Yazıcıoğlu, 1. Ulusal Biyoteknoloji Öğrenci Kongresindeki, "Rumexacetosella ve Rheumribes bitki türlerinin mide kanseri hücre hatları üzerindeki etkisi (Theeffect of Rumexacetosella and Rheumribes plant species on gastric cancercell lines)", sözlü bildiri, İstanbul, Türkiye, Mayıs 2009.
S. Gencer, M.B. Irmak-Yazıcıoğlu, III. Multidisipliner Kanser Araştırma Sempozyumu dahilinde Kongre cd'sindeki "AGS hücrelerinde MMP-3 geninin susturulmasının diğer MMP'lerin ekspresyonu üzerindeki etkileri", sözlü bildiri, Bursa, Türkiye, Mart 2010.